慢病毒包装出来后检测不到目标蛋白表达

2025年9月9日
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慢病毒包装出来后检测不到目标蛋白表达,常见原因主要集中在以下几个方面:

1. 载体设计与构建问题

  • 启动子不合适:使用了在所选细胞中活性较低或沉默的启动子(如CMV在某些细胞中容易失活)。

  • 插入片段问题:目标基因序列存在突变、移码、终止密码子或不完整的开放阅读框(ORF)。

  • 密码子偏好:外源基因未经过宿主细胞优化,翻译效率低。

  • 标签或融合蛋白影响:加上的标签(Flag、GFP等)影响了蛋白折叠或稳定性。

2. 病毒包装与滴度问题

  • 病毒滴度太低:感染效率不足,导致下游表达难以检测。

  • 包装质粒比例不当:转染时转运质粒(transfer plasmid)、包装质粒(gag/pol)、外壳质粒(VSV-G)的比例不合理。

  • 病毒降解或失活:冻融次数过多、储存条件不当(如反复冻融或长期放置)。

3. 靶细胞因素

  • 受体限制:细胞缺乏对包装病毒衣壳的受体或进入效率低。

  • 细胞类型限制:某些细胞系对外源基因沉默较强(如干细胞、原代细胞)。

  • 细胞状态:细胞过度融合、分裂速度过慢或过快都会影响转导效率。

4. 表达检测的问题

  • 检测方法敏感度不足:蛋白水平太低,用Western blot可能检测不到,但免疫荧光或qPCR可能能检测到mRNA。

  • 抗体特异性问题:检测抗体不识别融合形式或表位被折叠隐藏。

  • 时间点选择不当:转染或感染后检测过早或过晚,导致未捕捉到高表达期。

建议排查思路

  1. 先看滴度:用qPCR 或 p24 ELISA 定量病毒。

  2. 检测转录水平:做RT-qPCR,确认外源基因是否有转录。

  3. 换检测手段:如免疫荧光、流式细胞术,避免单一方法误判。

  4. 尝试对照实验

    • 换一个已知可表达的阳性对照载体(如GFP)。

    • 换不同细胞系测试。

    • 在质粒水平先验证表达,再转慢病毒。

关于派真

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