腺相关病毒(Adeno-Associated Virus,AAV)因其安全性高、免疫原性低、可实现长期表达,被广泛应用于神经、心脏、眼科等领域的基因功能研究和基因治疗开发。然而,在实际实验中,AAV 载体滴度偏低是研究人员最常遇到的问题之一。
需要强调的是,AAV 滴度并非由某一个步骤单独决定,而是受到载体设计、细胞与转染体系、培养与收获条件、纯化工艺以及检测方法等多个因素的共同影响。
一、载体设计是决定 AAV 滴度的基础
1. 插入片段大小需严格控制
AAV 的理论最大包装容量约为 4.7 kb(含 ITR)。当载体长度接近或超过该上限时,病毒包装效率会明显下降,并伴随不完整包装和空壳病毒比例升高。
建议:
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将载体长度控制在 2.5–4.7 kb 为理想范围
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精简启动子(如使用 mini-promoter)
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去除非必需调控元件或重复序列
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对超大基因可考虑 Dual AAV 策略
2. ITR 完整性必须得到保证
ITR 是 AAV 复制和包装的核心顺式作用元件。ITR 缺失或突变会直接导致病毒滴度显著降低,甚至无法成功包装。
常见问题:
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质粒在大肠杆菌中发生 ITR 重组
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常规一代测序无法覆盖 ITR 区域
建议:
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通过限制性内切酶酶切验证 ITR
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对高要求项目可采用 NGS 确认 ITR 完整性
二、细胞状态与转染体系直接决定滴度上限
3. 选择并维持高质量的包装细胞
常用包装细胞包括 HEK293、293T。转染时细胞应处于良好生长状态:
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汇合度:70–80%
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无支原体污染
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传代次数控制在合理范围内
细胞状态不佳,即使转染条件完全一致,也会显著拉低最终滴度。
4. 转染条件需系统优化
在三质粒系统中,载体质粒、rep/cap 质粒和 helper 质粒的比例对滴度影响明显。
常见参考比例:
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1 : 1 : 1
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1 : 1 : 2(提高 helper 比例有时更有利)
同时需要优化:
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DNA 总量
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PEI : DNA 比例(通常 2.5–3 : 1)
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转染体积与混匀方式
5. Rep/Cap 选择影响包装效率
不同 AAV 血清型的包装效率存在天然差异。例如:
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AAV2:稳定但整体滴度偏低
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AAV8 / AAV9:包装效率通常较高
此外,Rep 或 Cap 表达水平过高或过低,都会影响病毒装配效率。
三、培养与收获条件常被低估
6. 合理选择病毒收获时间
AAV 通常在转染后 48–72 小时 达到滴度峰值。收获时间过早或过晚都会影响最终产量。
建议针对不同载体结构和血清型,进行小规模时间点摸索。
7. 同时收集细胞和上清
并非所有 AAV 都主要存在于细胞内,尤其是 AAV8、AAV9 等血清型,上清中往往含有大量病毒颗粒。
建议:
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同时收集细胞和培养上清进行纯化
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可显著提高总体回收滴度
四、纯化方式不仅影响纯度,也影响滴度
8. 选择合适的纯化工艺
不同纯化方法对病毒回收率影响显著:
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CsCl 梯度:回收率高,但耗时较长
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Iodixanol 梯度:科研应用最常见,平衡度较好
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层析柱纯化:操作简便,但不当选择易导致滴度损失
9. 减少纯化过程中的病毒损耗
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避免反复冻融(不超过 2 次)
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使用低蛋白吸附耗材
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操作过程中减少剪切力和气泡产生
五、检测方式不同,结果不可直接对比
AAV 滴度检测方法差异较大,不同方法反映的“滴度”概念并不相同:
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qPCR / ddPCR:基因组滴度
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ELISA:衣壳滴度
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感染法:功能滴度
部分“高滴度但低表达”的情况,往往与 空壳病毒比例高或不完整包装有关。
六、进阶策略:进一步提升 AAV 滴度
对于高要求项目,可考虑:
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高滴度专用 rep/cap 系统
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稳定表达 rep/cap 的包装细胞系
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无血清或悬浮培养体系
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生物反应器规模化生产
AAV 载体滴度的提升并非单点优化,而是一个贯穿载体设计、生产和检测全流程的系统工程。从源头控制载体结构和 ITR 质量,再结合合适的包装体系和工艺优化,才能稳定获得高滴度、高质量的 AAV 病毒。
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