AAV 的基因组结构是什么样的

AAV（腺相关病毒, adeno-associated virus）的基因组是一个单链DNA（ssDNA），全长大约 4.7 kb，整体结构比较紧凑。

一、野生型 AAV 基因组的基本结构

通常可以概括为：ITR – rep – cap – ITR

1. ITR（inverted terminal repeats，反向末端重复序列）

位于基因组两端

每端大约 145 nt

是 AAV 基因组中最关键的顺式作用元件

作用包括：

• DNA复制起始
• 基因组包装
• 病毒拯救与整合相关过程

ITR 能形成发卡结构（hairpin），这对 AAV 的复制非常重要。

2. rep 基因

编码复制相关蛋白

主要产生 4 种蛋白：

• Rep78
• Rep68
• Rep52
• Rep40

主要功能：

• 调控病毒复制
• 调控转录
• 参与基因组包装
• 在某些情况下参与基因组整合

3. cap 基因

编码衣壳蛋白

主要产生：

• VP1
• VP2
• VP3

这三种蛋白共同组成病毒衣壳

此外 cap 区域还可编码一些辅助蛋白，如AAP（assembly-activating protein），参与衣壳装配

二、重组 AAV（rAAV）载体的基因组结构

在基因治疗里，常用的不是野生型 AAV，而是重组AAV载体。它的结构通常是：ITR – 启动子 – 目的基因 – polyA – ITR

也就是：

• 两端保留 ITR
• 中间的 rep 和 cap 被去掉
• 替换成你想表达的外源基因表达盒

特点

• ITR 是必须保留的
• rep/cap 不在载体基因组里，而是在包装时由辅助质粒提供
• AAV 的包装容量有限，一般约 4.7 kb，实际常建议外源表达盒控制在 4.4–4.8 kb 左右

三、简单示意图

野生型 AAV

重组 AAV 载体