随着腺相关病毒(Adeno-associated virus,AAV)在基因治疗领域的广泛应用,AAV滴度的准确测定变得极其重要。AAV滴度测定是指测量AAV病毒粒子的数量,通常根据病毒粒子中载体基因的拷贝数或是病毒颗粒的物理数量来进行。本文将对现行主流的AAV滴度检测方法进行概述。
实时定量PCR(qPCR)检测法
实时定量PCR是目前检测AAV滴度最常用的方法之一。它通过特异性扩增AAV载体中的序列,并实时监测扩增过程中产生的荧光信号,从而定量分析基因组拷贝数。该方法具有高灵敏度、准确性强、操作快速等特点,尤其适合于大批量样品检测。然而,该技术也存在一些局限性,比如需要制备高质量的标准品,并会受到样本纯度和PCR抑制物的影响。
数码滴定PCR(ddPCR)方法
ddPCR是一种新兴的绝对量化技术,通过将DNA样本分隔成上万个微小油滴,每个油滴内可能含有或不含有目标DNA模板,然后在每个油滴中进行PCR反应,通过计算包含目标序列油滴的数量,来精确估算出样品中的DNA拷贝数。ddPCR比qPCR拥有更高的精确度,且对于操作过程中的变异和样品杂质有更强的鲁棒性。对于需要高精确度AAV滴度测定的研究而言,ddPCR非常适用。
酶联免疫吸附测定(ELISA)
通过ELISA检测AAV的滴度涉及到使用抗AAV衣壳蛋白的抗体,来定量病毒颗粒。这种技术可以检测到包括空壳和含有基因组的完整病毒颗粒。ELISA法简单快速,而且成本较低,非常适合于有大量样本需要筛选的场合。但由于它无法区分空壳和完整病毒颗粒,因此有时需要与其他方法联合使用。
条件致病单倍体腺病毒辅助法(CAdVaH)
这种方法是基于一个事实,即AAV重组病毒在单倍体腺病毒的辅助下可以获得条件性的复制能力。在此基础上,通过计算感染的细胞数可以间接测得AAV的滴度。虽然该方法比较繁琐,但可以获得病毒感染性滴度的信息,对某些研究尤为重要。
基于方向性基因组捕获的测序(CATCH-Seq)
这是一项新技术,CATCH-Seq结合了基因组捕获和高通量测序来量化病毒基因组的拷贝数。这种方法可以提供滴度信息,并且能够检测到病毒基因组的结构变异和重排情况,赋予了研究者对AAV制备的深入了解。
病毒颗粒计数法
包括透射电镜和纳米粒子跟踪分析(NTA)两种方式。透射电镜可以直接观察病毒颗粒,但操作专业性强,成本高。NTA则通过测量溶液中病毒粒子的散射光或荧光来计数病毒,操作方便,重复性强,但需要专门的仪器设备。
AAV滴度的准确测量在基因疗法的研究和临床应用中起到了关键作用,而选择合适的检测方法则依据具体实验的需求及资源来定。实时定量PCR和数码滴定P CR因其高精度和快速性被广泛使用,而ELISA因成本低和操作简便而常用于高通量筛选。电镜和NTA等物理方法能够提供直接的病毒颗粒图像和数量,对滴度的直观理解尤为重要。随着技术的发展,结合多种方法来检测AAV滴度,以得到更全面、准确的病毒制备情况将成为未来的趋势。