慢病毒包装通常包括以下几个关键步骤:
1. 质粒设计与构建
质粒设计是慢病毒包装的第一步,通常涉及以下质粒:
- 载体质粒(transfer plasmid):含有目的基因(如shRNA、sgRNA、蛋白质编码基因)以及用于整合到宿主基因组中的长末端重复序列(LTR)。
- 包装质粒(packaging plasmid):提供病毒结构蛋白(如Gag、Pol等)的编码信息。
- 包膜质粒(envelope plasmid):通常使用VSV-G(水疱性口炎病毒糖蛋白)编码质粒,它决定了病毒的宿主范围。
2. 细胞转染
- 选择合适的细胞系(如HEK293T细胞)用于病毒包装。这些细胞易于转染且高效产生病毒颗粒。
- 将载体质粒、包装质粒和包膜质粒共转染到细胞中,通常使用PEI或Lipofectamine等转染试剂。
3. 病毒颗粒收集
- 转染后24-48小时,细胞会开始分泌慢病毒颗粒到培养基中。通常在转染48小时和72小时收集病毒上清液。
- 将收集的上清液通过0.45 μm滤器过滤以去除细胞碎片。
4. 病毒浓缩
- 如果需要高滴度病毒,可以通过超速离心、PEG沉淀或商用的病毒浓缩试剂盒浓缩病毒。
- 浓缩后可以将病毒颗粒重悬于适量缓冲液中。
5. 病毒滴度检测
- 为了确保病毒感染效率,通常会对包装的病毒颗粒进行滴度检测。
- 方法包括:流式细胞术(通过标记GFP或其他报告基因)、荧光定量PCR检测整合到基因组中的病毒基因量,或通过抗生素筛选的克隆形成单位。
6. 病毒保存
- 收集的病毒可以在4°C短期保存,或者在-80°C长期保存。