不同血清型的主要差异体现在以下几个方面：
- 组织靶向性（Tropism）：
- 不同血清型在感染不同组织时表现出明显的选择性，这种选择性由血清型的衣壳蛋白决定。
- 例如，AAV1主要靶向骨骼肌和心脏；AAV2主要靶向肝脏、视网膜和中枢神经系统；AAV5靶向肺、视网膜和中枢神经系统；AAV6表现出类似于AAV1的靶向性，主要靶向肌肉、肺和肝脏；AAV8非常高效地靶向肝脏，同时还可以感染肌肉、心脏和肾脏等组织；AAV9具有广泛的组织靶向性，尤其是其强大的跨血脑屏障能力，能够感染中枢神经系统、心脏和骨骼肌等组织。
- 免疫反应：
- AAV血清型的免疫原性也有所不同，这会影响其在体内的使用效果。人类对某些AAV血清型（如AAV2）可能已经存在中和抗体，限制其在基因治疗中的重复使用。
- 例如，AAV2由于被最早研究和广泛使用，很多人已经暴露于AAV2，因此人群中存在较高比例的中和抗体；AAV8相对于AAV2，人群中存在的中和抗体较少，因此在体内表现出更好的免疫逃逸能力；AAV9中和抗体的存在率较低，适合用于更广泛的人群，特别是用于全身性疾病的基因治疗。
- 基因转导效率：
- 不同血清型在特定组织中的基因转导效率差异显著，这影响了它们在不同疾病中的应用。
- 例如，AAV1和AAV6在肌肉组织中的转导效率较高；AAV2在视网膜和肝脏中具有较好的基因转导效率；AAV8在肝脏中的基因转导效率非常高；AAV9在神经系统中的转导效率高。
- 基因包装容量：
- AAV的基因包装容量相对较小，通常为约4.7 kb。不同血清型在基因包装容量上没有显著差异
腺相关病毒（AAV）在基因治疗中的优势主要体现在以下几个方面：
1.安全性：AAV不会导致任何人类疾病，主要以附加体形式存在，这使得AAV基因治疗具有很高的安全性。野生型AAV在体内引起疾病的可能性未知，但在去除大多数AAV基因组元素后，可以确保重组AAV基因在体内递送的进一步安全性。
2.免疫原性低：AAV在体内引起非常温和的免疫反应，这进一步支持其在基因递送过程中明显缺乏致病性。AAV载体的基因治疗已在靶器官（包括眼睛、肝脏、骨骼肌和中枢神经系统）的一系列试验中证明了安全性和长期疗效。
3.单次治疗、稳定表达、长期疗效：AAV介导的蛋白质治疗基因递送提供了持久的药理作用，可能允许整个治疗的单剂量给药。这对于可能需要多次剂量的神经系统和眼部疾病尤其重要。
4.血清型多，可选择性靶向不同的转染细胞，不同的组织器官：不同的AAV血清型具有不同的组织亲和性，这使得AAV可以靶向不同的细胞和组织，增加了基因治疗的灵活性和靶向性。
5.高效性：AAV载体基因疗法具有较高的基因转导效率，能有效将基因传递至目标细胞中。
6.持久性疗效：AAV基因疗法能够实现长期基因表达，因此可以产生持久性的疗效。
7.可控性：AAV载体基因疗法具有一定的可控性，可以通过调整载体的结构和基因的设计来实现对治疗效果的调节。
8.临床应用前景广阔：随着对AAV基因疗法的深入研究和临床实践，其在各种疾病治疗中的应用前景变得愈发广阔。
9.广泛的组织嗜性：AAV是非致病性的，很少整合到宿主基因组中，并且可以维持长期的转基因表达。
10.多样化的制造工艺：AAV载体已成为临床试验和FDA批准应用中的首选，因为它们具有广泛的组织嗜性、相对良好的安全性和多样化的制造工艺。