慢病毒载体与其他基因传递系统相比，具有以下几个主要优势：
长期稳定的基因表达：慢病毒载体能够将外源基因整合到宿主细胞的基因组中，实现长期的基因表达。这种整合性质使得慢病毒载体特别适合于需要长时间观察的实验或治疗。
广泛的细胞感染能力：慢病毒可以感染多种类型的细胞，包括分裂中的细胞和不分裂的细胞，如神经元、肝细胞等，使其成为研究复杂细胞类型的理想选择。
低免疫原性：与其他病毒载体相比，慢病毒载体引发的免疫反应相对较弱，因此在体内实验或基因治疗中更为安全，降低了因免疫反应引发的不良反应的风险。
适用于原代细胞和难转染细胞：慢病毒可以有效转导原代细胞以及其他难以通过传统方法转染的细胞，比如干细胞和神经元等。
相对较大的基因载体容量：慢病毒载体能够携带大约8-10 kb的外源基因片段，这比某些其他病毒载体容量更大，适合进行较大基因的转导。
适合基因治疗：因其长期稳定的基因表达能力和较低的免疫原性，慢病毒载体已被广泛用于基因治疗研究，尤其是慢性疾病和遗传病的治疗。
可感染非分裂细胞：慢病毒载体能有效感染并整合到非分裂细胞中，这是其他一些病毒载体如腺病毒和腺相关病毒所不具备的特性。
这些优势使得慢病毒载体在基因治疗和基因研究中具有广泛的应用价值。