质粒（plasmid）在基因治疗领域有广泛的应用，主要用于基因递送、基因编辑和疫苗开发等方面。具体应用包括以下几个方面：
1. 基因递送工具
质粒载体是一种常见的基因递送工具，可用于携带和递送治疗性基因。通过将质粒载体引入细胞内，可以在目标细胞中表达外源基因，进而补充或替代缺失或突变的基因功能。这对于治疗遗传性疾病（如血友病、囊性纤维化等）非常重要。
2. 基因编辑辅助
质粒可用于携带基因编辑工具（如CRISPR-Cas9系统）的成分，将其递送至细胞内进行基因组编辑。质粒携带的Cas9蛋白和向导RNA序列可以在体外或体内实现精准的基因切割和修复，从而纠正基因突变，潜在治疗遗传病、癌症等。
3. DNA疫苗
质粒在DNA疫苗的开发中发挥了关键作用。在质粒上插入编码病原体抗原的基因序列，可以将质粒注射到人体内，通过细胞自身表达抗原，诱导免疫反应。这类疫苗具有成本低、易于生产、稳定性高等优点，近年来在新冠疫苗等领域的应用也受到关注。
4. 免疫细胞疗法
在CAR-T（嵌合抗原受体T细胞）疗法中，质粒可用作基因修饰工具，将编码特异性抗原受体的基因导入T细胞。经过修饰的T细胞能够识别和攻击特定的癌细胞，质粒因此在肿瘤免疫治疗中发挥了重要作用。
5. 基因治疗的安全性研究
质粒载体通常相对安全，因为它们在大多数情况下不会整合到宿主基因组中，从而降低了基因组插入突变的风险。因此，在基因治疗的临床前研究中，质粒常用于评估基因疗法的安全性和有效性。