
AAV9滴度的测定方法有多种,以下是几种常见方法的介绍:
1. 实时定量PCR(qPCR)
qPCR是目前最常用的AAV滴度检测方法之一。它通过特异性扩增AAV载体中的序列,并实时监测扩增过程中产生的荧光信号,从而定量分析基因组拷贝数。这种方法具有高灵敏度、准确性强、操作快速等特点,尤其适合大批量样品检测。不过,qPCR需要高质量的标准品,并且可能会受到样本纯度和PCR抑制物的影响。
2. 数字滴定PCR(ddPCR)
ddPCR是一种新兴的绝对量化技术,通过将DNA样本分隔成上万个微小油滴,每个油滴内可能含有或不含有目标DNA模板,然后在每个油滴中进行PCR反应,通过计算包含目标序列油滴的数量,来精确估算出样品中的DNA拷贝数。ddPCR比qPCR拥有更高的精确度。
3. 酶联免疫吸附测定(ELISA)
ELISA通过使用抗AAV衣壳蛋白的抗体来定量病毒颗粒。这种方法可以检测到包括空壳和含有基因组的完整病毒颗粒。ELISA法简单快速,成本较低,适合大量样本的筛选。
4. TCID50
通过半数组织培养感染剂量(TCID50)方法,测定AAV9的感染性滴度。该方法利用HEK-293细胞作为宿主细胞,通过梯度稀释AAV9样品并感染细胞,培养后用实时荧光定量PCR(qPCR)检测AAV特异性反向末端重复序列(ITR),计算感染性滴度。
5. 透射电镜(TEM)和纳米粒子跟踪分析(NTA)
通过透射电镜直接观察病毒颗粒,或利用NTA技术测量溶液中病毒粒子的散射光或荧光来计数病毒颗粒。
优点:能够直观观察病毒颗粒形态,区分空壳和完整颗粒。
缺点:设备昂贵,操作复杂,且样品制备可能引入误差。
6. 基于方向性基因组捕获的测序(CATCH-Seq)
CATCH-Seq结合了基因组捕获和高通量测序来量化病毒基因组的拷贝数。这种方法不仅可以提供滴度信息,还能检测病毒基因组的结构变异和重排情况。
AAV9滴度测定方法的选择应根据实验需求、设备条件和经费限制进行权衡:
感染性滴度测定:推荐TCID50法。
基因组滴度测定:推荐qPCR或ddPCR法。
高通量筛选:推荐ELISA法。
病毒颗粒形态分析:推荐TEM或NTA法。
如需更详细的操作步骤或具体实验方案,可参考相关文献或技术文档
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