是的,基因片段可以借助辅助质粒(helper plasmid)进行病毒包装,尤其是在慢病毒(Lentivirus)、腺相关病毒(AAV)和腺病毒(Adenovirus)等病毒载体系统中。
1. 辅助质粒在病毒包装中的作用
辅助质粒通常提供病毒的包装蛋白(Packaging Proteins),帮助基因片段组装成病毒颗粒,而不携带病毒的全部基因组信息,因此不会产生具有复制能力的病毒。
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慢病毒(Lentivirus)系统
- 包装质粒(Packaging Plasmid):通常提供 gag、pol、rev、tat 等基因,用于编码病毒的结构和功能蛋白。
- 包膜质粒(Envelope Plasmid):如 VSV-G 质粒,提供病毒包膜蛋白,使病毒具有广谱感染能力。
- 转移质粒(Transfer Plasmid):携带目标基因片段,包含LTR(长末端重复序列),决定病毒的插入能力。
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腺相关病毒(AAV)系统
- Rep/Cap 质粒:提供 AAV 的复制和衣壳蛋白(Rep 和 Cap)。
- 辅助质粒(Helper Plasmid):通常由腺病毒基因 E2、E4、VA 组成,提供病毒包装所需的辅助功能。
- 转移质粒(Transfer Plasmid):携带目标基因,并包含 ITR(反向末端重复序列),确保基因组包装到 AAV 颗粒中。
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腺病毒(Adenovirus)系统
- 包装质粒(Packaging Plasmid):编码病毒结构蛋白。
- 辅助质粒(Helper Plasmid):提供早期基因(如 E1A、E1B),以支持腺病毒的复制和包装。
- 转移质粒(Transfer Plasmid):携带目标基因,通常插入到 E1 缺失的腺病毒载体中。
2. 实验流程
- 共转染(Co-transfection):将转移质粒、辅助质粒及包装质粒共转染到 HEK293T 细胞中。
- 病毒颗粒形成:细胞内表达病毒蛋白,并组装病毒颗粒,目标基因被封装进去。
- 病毒收获与纯化:48-72 小时后收集病毒上清,通过超速离心、透析等方法纯化。
- 病毒滴度测定:使用 qPCR、ELISA 或 TCID50 法测定病毒滴度,以确保感染效率。
3. 关键注意事项
- 选择合适的包装系统:不同的病毒系统适用于不同的实验需求,如 AAV 适用于体内基因治疗,慢病毒适用于稳定基因表达等。
- 优化转染条件:提高病毒包装效率,如使用优化的转染试剂、提高 DNA 纯度等。
- 病毒安全性考虑:慢病毒通常缺失关键的复制基因,使其成为复制缺陷型(Replication-deficient),但仍需在 P2 或 P3 实验室中操作。