GFP（绿色荧光蛋白）和 mCherry（红色荧光蛋白）都是常用的荧光蛋白标签，它们的主要区别如下：
1. 荧光颜色
GFP（Green Fluorescent Protein）：发出绿色荧光，激发波长约 488 nm，发射波长约 509 nm。
mCherry：发出红色荧光，激发波长约 587 nm，发射波长约 610 nm。
2. 光稳定性
GFP：光稳定性较好，适合长时间成像。
mCherry：比许多其他红色荧光蛋白（如DsRed）更稳定，但光稳定性通常略逊于GFP。
3. 光漂白耐受性
GFP：相对较强，但长时间高强度照射仍会导致漂白。
mCherry：相比 GFP 更耐光漂白，适用于长时间追踪实验。
4. 成熟时间
GFP：成熟速度较快。
mCherry：比 GFP 稍慢，但比 DsRed 这类红色荧光蛋白快得多。
5. pH 稳定性
GFP：在 pH 5.5 以上稳定，pH 过低时荧光会降低。
mCherry：对 pH 变化相对更稳定，适合用于酸性环境。
6. 应用场景
GFP：常用于一般细胞和组织荧光标记、活细胞成像、基因表达追踪等。
mCherry：由于其红色荧光，适合用于多色荧光成像（与 GFP 及其他荧光蛋白共标记），也用于活细胞成像、亚细胞定位等。
7. 多重标记兼容性
GFP：可与蓝色（BFP）、红色（mCherry、RFP）、远红色（mPlum、mKate）等荧光蛋白搭配使用。
mCherry：常与 GFP 搭配使用，可用于双重或多重荧光成像。
如果需要单一荧光标记且对颜色无特殊要求，GFP 是一个更稳定且高效的选择。
如果需要多色荧光成像，或者需要更耐光漂白的红色荧光蛋白，mCherry 是一个优选方案。