AAV超速离心后病毒条带在哪一层？

AAV 常用两种密度梯度超速离心方法：碘克沙醇（iodixanol）梯度 和 氯化铯（CsCl）梯度。两者的病毒条带位置不同👇

① Iodixanol 碘克沙醇密度梯度（最常用）

常见四层梯度：15% / 25% / 40% / 60%

✅ AAV 病毒颗粒条带位置：通常在 40% 与 60% 交界处

• 病毒颗粒密度 ~1.4 g/mL

• 因此会稳定在 40%（密度约1.32）与 60%（约1.41）的交界层

• 该条带乳白或略带蛋白颗粒感

离心管自上而下：

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│ 空气/样品层                               │

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│ 15% 碘克沙醇层 - 轻杂质                   │

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│ 25% 碘克沙醇层                           │

├═════════════════════════════════════┤ ← 空衣壳条带（通常在此界面）

│ 40% 碘克沙醇层                           │

├═════════════════════════════════════┤ ← AAV完整病毒目的条带（在此界面）

│ 60% 碘克沙醇层                           │

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│ 沉淀 - 重杂质（细胞碎片等）              │

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📌 小提示

• 空壳 (empty capsid) 会稍微靠上（更接近 40%）

• 满载（full capsid） 更靠近 60%
  （但 iodixanol 并不能很好分离 empty / full）

② CsCl 密度梯度（可分离空壳/满壳）

AAV 在 CsCl 梯度中会分成两条（或一条）明显条带：

✅ 满载 Full AAV：密度 1.40 g/mL（更低位置、更靠下）

🌫️ 空壳 Empty capsid：密度 1.32–1.35 g/mL（靠上）

你会看到：

• 上层：空壳条带

• 下层：满壳条带（通常更亮、更明显）

CsCl 可以分得较干净，但对病毒活性影响较大，因此现在更常用 iodixanol + 柱层析。