AAV的ITR（Inverted Terminal Repeat，倒置末端重复序列）是腺相关病毒（Adeno-Associated Virus, AAV）基因组的关键结构元件之一。这些序列位于AAV基因组的两端（5′ 和 3’），通常是145碱基对左右的高度保守结构。ITR序列在AAV病毒的复制、包装和整合过程中起着非常重要的作用。
1.ITR序列的主要功能
(1)模板功能：
ITR序列在病毒DNA复制过程中起到引导作用，可以形成发夹状的结构，提供3’末端作为DNA合成的起始点。
这种自引导复制方式是AAV的一种特性，称为“单链DNA复制”。
(2)基因包装：ITR是病毒基因组被包装进病毒衣壳的必需序列。没有ITR的DNA序列无法被AAV的衣壳识别和有效包装。
(3)宿主基因组整合：在某些条件下，AAV可以通过ITR序列与宿主细胞基因组特定位点（例如人类19号染色体上的AAVS1位点）整合。尽管重组型AAV（rAAV）在基因治疗中通常不整合到宿主基因组中，但原始野生型AAV具备这种能力。
(4)保护基因稳定性：ITR的特定结构可以保护基因组的完整性，减少降解。
2.ITR的结构特点
(1)发夹结构：ITR序列是一个具有倒置重复序列的区域，可以形成发夹状的二级结构。这种结构对于AAV的功能至关重要。
(2)高度保守性：不同的AAV血清型（如AAV2、AAV8）之间，ITR序列的变化非常小，表明其对病毒生命周期的核心作用。
3.ITR在基因治疗中的应用
在基因治疗中，重组AAV载体通常保留两端的ITR序列，并将中间的病毒基因去除，用于插入治疗基因。这些ITR序列是必不可少的，因为它们负责病毒载体的复制和包装，同时确保治疗基因能够在靶细胞中表达。
总结
AAV的ITR序列是AAV基因组的关键调控元件，其功能包括复制、包装和整合等，是AAV基因治疗技术的基础部分。