AAV（腺相关病毒，Adeno-Associated Virus）的血清型由其衣壳蛋白（capsid protein）的结构决定。具体来说，AAV的血清型主要由编码衣壳蛋白的 cap 基因 序列变化引起，不同的血清型具有不同的表面抗原特性，从而决定了它们的免疫原性、细胞感染特异性和组织嗜性。
关键决定因素：
1.衣壳蛋白（Cap Protein）
AAV的衣壳由三种蛋白质（VP1、VP2 和 VP3）组成，这些蛋白由同一个 cap 基因通过不同的起始密码子翻译生成。不同的血清型在 cap 基因序列上的差异，导致衣壳蛋白的氨基酸序列和三维结构发生变化，从而决定其抗原性和感染特性。
2.表面抗原（Surface Antigen）
不同血清型的衣壳表面抗原具有特异性，这决定了它们与宿主细胞表面受体的结合能力，以及是否会被宿主免疫系统识别。
3.宿主细胞受体结合特性
不同血清型的AAV会与不同的细胞受体结合，例如：
AAV2：主要与肝素硫酸蛋白多糖（HSPG）结合。
AAV5：结合唾液酸相关受体。
AAV9：可以广泛感染多种组织，尤其是心脏和中枢神经系统。
4.进化来源和分类
根据分子进化分析，不同血清型来源于不同的进化分支，目前已发现的天然AAV血清型包括AAV1至AAV13，以及一些实验室通过突变改造生成的变体。
常见AAV血清型及其特点：
AAV1：肌肉组织高效感染。
AAV2：广泛应用于基因治疗，感染范围广。
AAV5：肺部和中枢神经系统具有特异性。
AAV8：肝脏高效感染。
AAV9：心脏、肝脏和中枢神经系统感染效果显著。
通过对 cap 基因进行改造或使用衣壳重定向技术，可以设计出具有特定组织嗜性的AAV载体，用于基因治疗和其他生物医学应用。