基因敲低（knockdown）和基因敲除（knockout）都是研究基因功能的重要技术手段，但两者在机制、效果和应用上存在明显区别：
1. 定义与机制
基因敲低（knockdown）：
是暂时性或部分抑制某个基因的表达。
通常通过RNA干扰（RNAi）手段（如siRNA、shRNA）减少mRNA的表达量，从而降低蛋白质的合成。
细胞中该基因仍然存在，但表达水平大大降低。
基因敲除（knockout）：
是永久性完全删除或失活某个基因。
通过CRISPR/Cas9、TALEN、ZFN等基因编辑技术，直接在DNA水平上改变基因，使其不再表达功能性蛋白质。
该基因在基因组中被“去除”或“破坏”。
2. 效果强度
敲低：表达减少，但通常仍有残余表达（比如降低90%）。
敲除：表达完全丧失（彻底缺失或失活）。
3. 稳定性
敲低：
一般是短期或可逆性的（尤其是siRNA处理）。
适合暂时性实验或避免完全缺失致死的情况。
敲除：
是永久性改变，可用于构建稳定细胞系或动物模型。
4. 应用场景
| 应用 | 敲低 | 敲除 |
| 快速初筛 | ✅ | ❌ |
| 研究必需基因 | ✅（残留表达） | ❌（可能致死） |
| 功能验证 | ✅ | ✅ |
| 构建稳定模型 | ❌ | ✅ |
| 药物靶点研究 | ✅ | ✅ |
5. 技术手段举例
| 技术 | 敲低 | 敲除 |
| siRNA / shRNA | ✅ | ❌ |
| CRISPR干扰（CRISPRi） | ✅ | ❌ |
| CRISPR/Cas9切割 | ❌ | ✅ |
| 同源重组技术 | ❌ | ✅ |