一、按血清型分类（决定组织嗜性）
AAV 的血清型不同，其对不同组织和器官的亲和性也不同，常见的包括：
| 血清型 | 特点与用途 |
| AAV1 | 高效感染骨骼肌、神经组织 |
| AAV2 | 最早被研究，广泛使用，对多种细胞有较强亲和性，适合体外感染 |
| AAV5 | 感染肺部、神经系统和肝脏较好 |
| AAV6 | 与AAV1类似，也适合感染肌肉 |
| AAV8 | 对肝脏感染效率极高，常用于肝脏靶向表达 |
| AAV9 | 可穿越血脑屏障，适合中枢神经系统、心脏 |
| AAVrh10 | 来源于灵长类，神经系统感染效率高 |
工程化 AAV 变体
AAV-DJ 和 AAV-DJ/8：通过改造获得的工程化 AAV，具有更强的血脑屏障穿透能力和神经系统转导效率。
AAV-PHP.eB 和 AAV-PHP.S：这些变体经过优化，能够更高效地穿越血脑屏障，用于中枢神经系统的研究和治疗。
AAV2-retro：经过改造后能够实现逆转录，用于特定的基因治疗场景。
二、按功能构建分类（AAV 工具载体类型）
| 工具类型 | 功能 | 应用举例 |
| AAV-CMV-GFP | 高表达GFP的AAV，常用作对照或检测感染效率 | 可用于细胞或动物中观察表达 |
| AAV-shRNA/miRNA | 表达干扰RNA以敲低基因 | 基因功能研究 |
| AAV-Cre | 表达Cre重组酶，进行loxP位点特异重组 | 条件性敲除模型 |
| AAV-hSyn-GFP | 使用神经特异启动子（如 hSyn）控制表达 | 神经元特异性表达 |
| AAV-GCaMP | 表达钙指示器，用于活体钙成像 | 神经活动监测 |
| AAV-sgRNA 或 AAV-Cas9 | 基因编辑用，常和CRISPR/Cas系统结合使用 | 用于基因敲除或编辑 |
AAV 工具病毒因其多样性和高效性，被广泛应用于基因治疗、神经科学研究等领域。