质粒DNA提取是实验室中常见的一项技术,用以从细菌中获得纯化的质粒DNA。实验通常涉及一系列的步骤,用以破坏细菌细胞、提取DNA、纯化并收集质粒。以下是质粒DNA提取的一般实验步骤:
步骤 1: 细菌培养
开始之前,需要将含有目标质粒的细菌菌株接种于含有适当抗生素的液体培养基中,通常培养一夜以获得充足的细菌生长。
步骤 2: 收集细菌细胞
使用离心机收集培养液中的细菌细胞。具体来说,将培养液转移至离心管中,使用离心机高速旋转几分钟,以沉淀细胞。
步骤 3: 裂解细胞
移除细菌细胞的上清液后,加入裂解液(含有碱性溶液和表面活性剂,如SDS),彻底混合后置于室温放置几分钟,充分裂解细胞,释放质粒DNA。
步骤 4: 中和和沉淀
加入中和液(通常含有醋酸盐),并迅速混合,以使混合液PH下降,导致蛋白质和细菌染色体DNA沉淀,而质粒DNA则因体积较小而保持在溶液中。
步骤 5: 分离
将混合液离心,沉淀蛋白质和细菌染色体DNA,将含有质粒的上清液转移到新的离心管中。
步骤 6: 纯化质粒DNA
在上清液中加入特定的纯化试剂或纯化步骤(比如使用层析柱或磁珠),根据具体方法说明去除剩余杂质,获得纯净的质粒DNA。
步骤 7: 沉淀质粒DNA
为了收集和浓缩质粒DNA,可能需要添加乙醇或异丙醇,并在低温下离心以沉淀DNA,然后去除上清液。
步骤 8: 洗涤和干燥
用70%乙醇对质粒DNA沉淀进行洗涤,去除残留的盐类和杂质,随后离心并弃去洗涤液。让DNA沉淀略微空气干燥或在真空干燥机中轻轻干燥。
步骤 9: 重悬并保存
将干燥的DNA沉淀用TE缓冲液(Tris-EDTA)或无菌水重悬,并经过充分混匀。这时的质粒DNA可用于后续实验,或在适当的条件下储存。
这些步骤可能根据具体的实验需求和所用的商业试剂盒有所不同。商业试剂盒通常提供了优化的试剂和详细的操作流程,以便进行快速和高效的提取。值得注意的是操作中的洁净和准确性对实验结果有显著影响,实验中应避免DNA酶污染,确保质粒DNA的质量与纯度。
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